V biologii jde o označení pro živý obsah buňky, tedy aktivní hmotu schopnou metabolismu a reakcí na okolí, složenou hlavně z vodného prostředí s rozpuštěnými a rozptýlenými biomolekulami. V tradičním pojetí se tím myslí souhrn cytoplazmy i buněčného jádra, přičemž název vychází z řeckého protos ve významu prvotní.