Jde o sepsi vyvolanou tím, že bakterie pocházející ze střeva proniknou přes narušenou střevní bariéru do krevního řečiště a následně spustí celotělovou zánětlivou odpověď. Tento mechanismus se označuje jako bakteriální translokace a častěji se uplatňuje při závažném oslabení organismu, po velkých výkonech v dutině břišní nebo při poškození střevní sliznice například ischemickými změnami.