5-hydroxytryptamin (5-HT) je biogenní amin vznikající z aminokyseliny tryptofanu. Jde o biologicky účinnou látku, která v centrální nervové soustavě působí jako neurotransmiter, zároveň se nachází v krevních destičkách a v řadě dalších tkání. Způsobuje zúžení cév (vazokonstrikci), a tím přispívá k hemostáze a zástavě krvácení. Podílí se na zánětlivých i alergických dějích, mimo jiné může vyvolávat zúžení průdušek, a uplatňuje se i v dalších patologických stavech, ve zvýšeném množství jej někdy produkují karcinoidy. V mozku se prostřednictvím neurotransmise zapojuje také do procesů souvisejících se vznikem a regulací nálady. Léčiva ovlivňující jeho metabolismus či přenos v mozku se používají v psychiatrii (např. SSRI = selektivní inhibitory zpětného vychytávání 5-hydroxytryptaminu), dále při léčbě migrény aj. Antagonisté/inhibitory receptorů 5-HT3 patří mezi účinná antiemetika, tedy léky tlumící nevolnost a zvracení.