Centromera (též centroméra, z lat. centrum – střed a řec. méros – část) je specializovaná oblast chromozomu, která při buněčném dělení zajišťuje jeho správné rozdělení do dceřiných buněk. Na zdvojeném chromozomu se projevuje jako primární zúžení (konstrikce), v jehož okolí zůstávají sesterské chromatidy spojeny až do jejich oddělení. Na centromeře se vytváří bílkovinný komplex kinetochor, k němuž se při mitóze a meióze připojují mikrotubuly dělicího vřeténka a umožňují pohyb chromozomů. U člověka obsahuje centromerická oblast převážně opakující se úseky DNA zvané alfa-satelitní DNA, pro její funkci je důležité také zvláštní uspořádání chromatinu s proteinem CENP-A. Centromera nemusí ležet přesně uprostřed chromozomu. Podle její polohy se rozlišují chromozomy metacentrické, submetacentrické a akrocentrické, vymezuje jejich krátké raménko p a dlouhé raménko q. Poruchy činnosti centromery mohou vést k chybnému rozchodu chromozomů a aneuploidii, tedy odchylce v jejich počtu.