Kokcidie, tedy jednobuněční parazitičtí prvoci ze skupiny Sporozoa, kteří se množí uvnitř buněk hostitele a velmi často napadají střevo a další části trávicí soustavy.
V lékařské a zejména veterinární praxi se tímto označením rozumějí původci kokcidiózy, střevní nákazy šířené odolnými oocystami vylučovanými trusem, jež může vyvolat průjem a celkové oslabení.