Fistulektomie je chirurgický zákrok, při němž se píštěl vyřízne a odstraní jako celek, obvykle v celé délce jejího kanálu. Označení je odvozeno z l. fistula a z ř. ektome a v praxi jde o radikálnější postup, který má omezit možnost znovuobjevení píštěle.