V cytologii jde o membránový váček vznikající splynutím fagosomu s lysozomem. V jeho lumen se pohlcené částice a patogeny štěpí pomocí lysozomálních enzymů a v kyselém prostředí, takže je klíčový pro průběh fagocytózy a intracelulární trávení. Název je odvozen z řec. fagein jíst a řec. lysosoma tělísko uvnitř buňky, někdy se uvádí také jako fagolyzosom nebo sekundární lyzosom.