Metabolometrie označuje kvantitativní měření metabolismu, tedy sledování a vyhodnocení intenzity látkových přeměn v organismu, tkáni nebo buňkách. Název vychází z řeckého metabole ve významu přeměna a z přípony -metria, která vyjadřuje měření. V praxi se může odhadovat například z dýchacích parametrů nebo ze změn hladin vybraných metabolitů.